在Git中，可以使用以下命令清空最顶层的工作目录：
git reset --hard HEAD其中，git reset命令用于重置当前分支的HEAD指针，--hard参数表示重置后将工作目录和暂存区都恢复到与HEAD指针相同的状态，HEAD表示当前分支的最新提交。
需要注意的是，使用该命令将会清空工作目录中所有未提交的更改，包括新建的文件和修改的文件等，因此在执行命令前，需要确保工作目录中没有重要的未提交更改。
执行完该命令后，可以将来自另一个仓库的数据拉取到本地仓库中，使用git pull命令即可。如果需要拉取指定分支的数据，可以使用以下命令：
git pull <远程仓库名> <远程分支名>:<本地分支名>其中，<远程仓库名>表示远程仓库的名称，<远程分支名>表示远程分支的名称，<本地分支名>表示将要创建或更新的本地分支名称。
执行完该命令后，本地仓库中的工作目录就会被更新为最新的代码。