要从远程服务器下载Git存储库并刷新md5校验和，需要执行以下步骤：
从命令行终端进入要下载存储库的目录。 (命令行终端 和 目录)
使用git clone命令将存储库克隆到本地。在命令中提供存储库的URL地址。(git clone和URL地址)
进入clone后的本地存储库目录，在命令行中运行md5sum命令来生成文件的md5校验和，比较该结果与之前记录的校验和，以确保文件的完整性和一致性。(md5sum和校验和比较)
示例如下：
cd /path/to/local/repository # 进入本地存储库目录
git clone <remote_repository_URL> # 将存储库克隆到本地
cd repository_name # 进入下载后的存储库目录
md5sum file_name # 生成文件的md5校验和请注意，在这个过程中，请确保您有足够的权限访问和下载Git存储库。