在 Git 中对目录结构和文件删除进行管理和恢复的关键词包括：删除、管理、恢复、文件、目录结构。
Git中的删除操作分为两种情况：删除已跟踪的文件和删除未跟踪的文件。
当我们使用git add命令将文件添加到Git中进行跟踪后，如果要删除该文件，可以使用git rm命令。例如，如果要删除名为example.txt的文件，可以使用以下命令：
git rm example.txt这个命令将会删除example.txt文件，并将删除操作记录在Git的版本历史中。如果我们不希望真正删除文件，而是只是将其从Git跟踪列表中删除，可以使用--cached选项。例如：
git rm --cached example.txt这个命令将会将example.txt从Git跟踪列表中删除，但是不会真正删除文件。
如果要删除未跟踪的文件，可以使用git clean命令。例如，如果要删除所有未跟踪的文件和目录，可以使用以下命令：
git clean -f -d这个命令将会删除所有未跟踪的文件和目录，包括空目录。
对于已经删除的文件和目录，我们可以使用git checkout命令进行恢复。例如，如果要恢复名为example.txt的文件，可以使用以下命令：
git checkout example.txt这个命令将会从Git的版本历史中恢复example.txt文件。
对于删除的目录结构，我们可以使用git checkout命令恢复目录下所有的文件和子目录，或者使用git stash命令将删除操作暂存，以便在需要的时候进行恢复。