是的，不同协议的URL格式会影响SEO，其中HTTPS协议对于SEO来说更加重要。
在搜索引擎优化中，URL结构也被认为是非常重要的因素之一。对于搜索引擎来说，易于理解和可读的URL结构可以提高网站的可信度和排名。而URL的协议部分也会影响SEO，主要表现在以下几个方面：
安全性：HTTPS协议比HTTP更加安全，可以防止黑客攻击和信息泄露。因此，搜索引擎对于HTTPS协议的网站更加青睐，HTTPS协议可以提高网站排名。
可靠性：使用HTTPS协议可以保证访问者与服务器之间的通信是经过加密的，这有助于消除中间人攻击和窃听等问题，提高网站的可靠性和稳定性。
用户体验：HTTPS协议对于用户来说更加友好，可以提供更安全、更完善的用户体验。而且，谷歌浏览器等流行的浏览器会标记使用HTTP协议的网站为“不安全”，这会影响到用户对于网站的信任度和访问量。
因此，对于SEO来说，使用HTTPS协议的网站相对于使用HTTP协议的网站更加有优势，可以提高网站的排名并提供更好的用户体验。而且，如果您使用了HTTPS协议，还需要确保URL的其他部分（如域名、路径等）也是友好、可读的，这同样可以提高网站的排名。