在小程序中运营完整的知识产权保护体系，需要遵循以下关键步骤：
注册和申请知识产权：在小程序开发和运营之前，应该先申请商标、专利、著作权等知识产权，确保自己的权益受到法律的保护。
完善知识产权保护策略：在小程序中，应该明确知识产权保护的政策和规则，比如禁止侵权、保护原创等，同时建立完善的举报机制和处理流程。
监测侵权行为：通过专业的监测工具，及时发现侵权行为，并采取必要的防范措施。
处理侵权投诉：如果收到侵权投诉，应该及时回应并采取行动，包括撤下涉嫌侵权内容、与原告协商解决等。
拓展合法授权渠道：为了避免侵权和维护知识产权，可以通过授权合法的方式，让其他开发者或商家在小程序中使用自己的品牌、设计等。
宣传知识产权保护理念：通过各种途径，向用户传递知识产权保护的重要性和理念，增强用户意识和参与度。
以上关键步骤是小程序中运营完整的知识产权保护体系的基础，必须要严格遵循和执行。