在小程序中运用地理信息系统（GIS）来精准推送消息的关键在于获取用户的地理位置信息，并将该信息与地图数据进行匹配分析，从而得出用户所在的具体位置。这样就可以根据用户所在位置，向其推送与该位置相关的信息。具体实现的步骤如下：
小程序可以通过调用微信提供的API获取用户的地理位置信息，例如使用wx.getLocation()方法获取用户当前的经纬度坐标。
将用户的地理位置信息与地图数据进行匹配分析，可以得出用户所在的具体位置。这可以通过引入GIS技术进行实现，例如使用ArcGIS等地理信息系统软件进行分析。
根据用户所在位置，可以向其推送与该位置相关的信息。例如，如果用户所在的位置是一家餐厅附近，可以向其推送该餐厅的优惠信息或者其他相关的推荐信息。
需要注意的是，为了保护用户隐私，小程序需要在获取用户地理位置信息时进行用户授权，并且在使用完毕后及时销毁相关信息。此外，在使用GIS技术时也需要遵循相关的法律法规，尤其是涉及到地图数据的使用和分析时，需要注意保护地图数据的版权和隐私。